Search
Biologia computacional i sintètica
Personal
Personal
Investigadors postdoctorals
Estudiants de doctorat
Estudiants de grau o màster
Descripció general
El nostre grup està interessat en aplicar tècniques que van des de l'aprenentatge automàtic modern i la biologia estructural computacional fins a mètodes experimentals d'alt rendiment com el cribratge basat en NGS, per tal d'entendre com la variació genètica afecta els fenotips biològics (enginyeria inversa), així com per dissenyar l'ADN. seqüències que poden generar fenotips desitjats (enginyeria avançada). Actualment, estem estudiant com les mutacions afecten l'expressió gènica heteròloga i la regulació transcripcional de les microalgues.
Publicacions seleccionades
Milito A, Aschern M, McQuillan JL, Yang JS*
Challenges and advances towards the rational design of microalgal synthetic promoters in Chlamydomonas reinhardtii.
(2023) Journal of Experimental Botany, erad100
Hwang HG, Milito A, Yang JS*, Jang S*, Jung GY*.
Riboswitch-guided chalcone synthase engineering and metabolic flux optimization for enhanced production of flavonoids.
(2022) Metabolic Engineering, 75:143-152
Ye DY, Noh MH, Moon JH, Milito A, Kim M, Lee JW, Yang JS*, Jung GY*.
Kinetic compartmentalization by unnatural reaction for itaconate production.
(2022) Nature Communications, 13(1):5353
Lang, B.*, Yang, J.-S.*, Garriga-Canut, M.*, Speroni, S., Aschern, M., Gili, M., Hoffmann, T., Tartaglia, G.G., Maurer, S.P.
Matrix-screening reveals a vast potential for direct protein-protein interactions among RNA binding proteins
(2021) Nucleic Acids Research, 49 (12), pp. 6702-6721.
Weber, M., Burgos, R., Yus, E., Yang, J.-S., Lluch-Senar, M., Serrano, L.
Impact of C-terminal amino acid composition on protein expression in bacteria
(2020) Molecular Systems Biology, 16 (5), art. no. e9208, .
Park, S.V.*, Yang, J.-S.*, Jo, H., Kang, B., Oh, S.S., Jung, G.Y.
Catalytic RNA, ribozyme, and its applications in synthetic biology
(2019) Biotechnology Advances, 37 (8), art. no. 107452, .
Yang J.S.*# Garriga-Canut M.*, Link N., Carolis C., Broadbent K., Beltran-Sastre V., Serrano L., Maurer S.P.#
rec-YnH enables simultaneous many-by-many detection of direct protein-protein and protein-RNA interactions
(2018) Nature Communications, 9(1):3747
Yus E.*, Yang J.S.*, Sogues A., Serrano L.
A reporter system coupled with high-throughput sequencing unveils key bacterial transcription and translation determinants
(2017) Nature Communications, 8(1):368