Epigenètica i desenvolupament vegetal

Líders de grup
Julia Qüesta
Junior Leader Incoming Fellowship la Caixa
Membres del grup
Epigenetics and plant development

Investigadors postdoctorals

Estudiants de doctorat

Estudiants de grau o màster

Descripció general

El nostre laboratori està interessat en entendre els mecanismes epigenètics que controlen el desenvolupament de les plantes. Durant el seu cicle de vida, les plantes experimenten diverses transicions de fase; de gametofític a esporòfit, embrionari a vegetatiu i vegetatiu a reproductiu. Tots aquests canvis de desenvolupament es basen en el moment i la seqüència correcta dels patrons d'expressió gènica entre les etapes individuals. La dinàmica de la cromatina i els mecanismes epigenètics han estat àmpliament implicats en la regulació de les transicions de fase. A més, recentment s'han relacionat els ARN no codificants llargs de les plantes (lncRNAs) amb processos clau com l'organogènesi, la fotomorfogènesi i la transició floral.

Sorprenentment, les plantes no poden moure's, la qual cosa implica que els diferents interruptors de desenvolupament han d'estar ben alineats amb indicis externs específics (temperatura, humitat i qualitat de la llum) de les diferents estacions. Per ser capaços d'inferir informació estacional, les plantes han desenvolupat sistemes per detectar senyals ambientals i també per "recordar" l'exposició anterior a aquests senyals. En altres paraules, tot i que les plantes no tenen cervell, presenten clarament un tipus de "memòria molecular" que es coneix com a memòria epigenètica.

L'objectiu del nostre equip d'investigació és dilucidar com els lncRNA i la maquinària de silenciament de la cromatina desencadenen la memòria epigenètica a les plantes. Per investigar aquesta fascinant línia de recerca, estem combinant enfocaments epigenòmics, proteòmics, de bioimatge i genètics. Pretenem descobrir l'enllaç que falta entre la detecció ambiental i el silenciament epigenètic, aprofitant Arabidopsis i el blat de moro com a espècies model.

Publicacions seleccionades

Tremblay BJM, Santini CP, Cheng Y, Zhang X, Rosa S, Qüesta JI.
Interplay between coding and non-coding regulation drives the Arabidopsis seed-to-seedling transition.
(2024) Nature Communications, 5(1):1724. DOI: 10.1038/s41467-024-46082-5.

Larran AS, Pajoro A, Qüesta JI.
Is winter coming? Impact of the changing climate on plant responses to cold temperature.
(2023) Plant, Cell and Environment, 46(11):3175-3193. DOI: 10.1111/pce.14669.

Tremblay BJM, Qüesta JI.
Mechanisms of epigenetic regulation of transcription by lncRNAs in plants.
(2022) IUBMB Life. DOI: 10.1002/iub.2681.

Jarad M, Antoniou-Kourounioti RL, Hepworth J, Qüesta JI.
Unique and contrasting effects of light and temperature cues on plant transcriptional programs.
(2020) Transcription, 11(3-4):134-159. DOI: 10.1080/21541264.2020.1820299.

Qüesta JI*, Antoniou-Kourounioti RL*, Rosa S, Li P, Duncan S, Whittaker C, Howard M, Dean C.
Non-coding SNPs influence a distinct phase of Polycomb silencing to destabilise long-term epigenetic memory at Arabidopsis FLC.
(2020) Genes and Development, 34(5-6):446-461. DOI:10.1101/gad.333245.119.

Qüesta JI, Song J, Geraldo N, An H, Dean C.
Arabidopsis transcriptional repressor VAL1 triggers Polycomb silencing at FLC during vernalization.
(2016) Science, 29;353(6298):485-8. DOI: 10.1126/science.aaf7354.