Genètica i genòmica de cultius hortícoles

Líders de grup
Jordi Garcia-Mas
IRTA Researcher

Descripció general

La nostra recerca se centra a desenvolupar eines genètiques i genòmiques per a la caracterització de caràcters agronòmics importants en el meló i espècies hortícoles relacionades. Desenvolupem les nostres activitats en el marc de projectes finançats amb fons públics competitius o en col·laboració amb empreses privades. Apliquem rutinàriament una àmplia gamma d'enfocaments genètics, genòmics, metabolòmics, bioinformàtics i fenotípics a les principals línies de recerca del nostre grup:

- Caracteritzar la maduració del fruit de meló i comprendre les bases moleculars de la maduració no climatèrica que es troba en els genotips del meló tipus inodorus. - Aplicació de tecnologies d'edició genètica per a la validació funcional de gens candidats per caràcters del meló.

- Millorant el genoma de referència del meló mitjançant l'aplicació de tecnologies de seqüenciació d'avantguarda.

- Anàlisi de la variabilitat existent en el germoplasma del meló mitjançant aproximacions de re-seqüenciació.

- Obtenció de marcadors moleculars per a la millora assistida per marcadors de caràcters qualitatius i quantitatius en cultius de cucurbitàcies i solanàcies.

Publicacions seleccionades

Santo Domingo M, Orduña L, Navarro D, Mayobre C, Santiago A, Valverde L, Alexiou KG, Matus JT, Pujol M, Garcia-Mas J.
The ethylene-responsive transcription factor ERF024 is a novel regulator of climacteric fruit ripening in melon.
(2024) The Plant Journal (in press)

Pujol M, Garcia-Mas J.
Regulation of climacteric fruit ripening in melon: recent advances and future challenges.
(2023) Journal of Experimental Botany, 74, 6224-6236

Giordano A, Santo Domingo M, Quadrana L, Pujol M, Martin-Hernandez AM, Garcia-Mas J.
CRISPR/Cas9 gene editing uncovers the roles of CONSTITUTIVE TRIPLE RESPONSE 1 and REPRESSOR OF SILENCING 1 in melon fruit ripening and epigenetic regulation.
(2022) Journal of Experimental Botany, 73, 40222-4033

Santo Domingo M, Areco L, Mayobre C, Valverde L, Martín-Hernández AM, Pujol M, Garcia-Mas J.
Modulating climacteric intensity in melon through QTL Stacking.
(2022) Horticulture Research, 9, uhac131

Mayobre C, Pereira L, Eltahiri A, Bar E, Lewinsohn E, Garcia-Mas J, Pujol M.
Genetic dissection of aroma biosynthesis in melon and its relationship with climacteric ripening.
(2021) Food Chemistry, 353, 129484/p>

Pereira L, Santo Domingo M, Ruggieri V, Argyris J, Phillips MA, Zhao G, Lian Q, Xu Y, Huang S, Pujol M, Garcia-Mas J.
Genetic dissection of climacteric fruit ripening in a melon population segregating for ripening behavior.
(2020) Horticulture Research, 7, 187

Zhao G, Lian Q, Zhang Z et al.
A comprehensive genome variation map of melon identifies multiple domestication events and loci influencing agronomic traits.
(2019) Nature Genetics, 51, 1607-1615

Lü P, Yu S, Zhu N, Chen Y-R, Zhou B, Pan Y, Tzeng D, Fabi JP, Argyris J, Garcia-Mas J, Ye N, Zhang J, Grierson D, Xiang J, Fei Z, Giovannoni J, Zhong S
Genome encode analyses reveal the basis of convergent evolution of fleshy fruit ripening. 
(2018) Nature Plants, 4(10), 784-791

Pereira L, Pujol M, Garcia-Mas J, Phillips MA
Non-invasive ethylene quantification in attached fruit headspace at 1 ppb by gas chromatography – mass spectrometry. 
(2017) The Plant Journal 91:172-183

Ríos P,  Argyris J, Vegas J, Leida C, Kenigswald M, Tzuri G, Troadec C, Bendahmane A, Katzir N, Picó B, Monforte AJ, Garcia-Mas J 
ETHQV6.3 is involved in melon climacteric fruit ripening and is encoded by a NAC domain transcription factor. 
(2017) The Plant Journal 91: 671-683

Garcia-Mas J, Benjak A, Sanseverino W, Bourgeois M, Mir G et al 
The genome of melon (Cucumis melo L.)
(2012) Proc Natl Acad Sci USA 109:11872-11877