Search
Genètica i genòmica de rosàcies
Personal
Personal
Investigadors
Serveis científics
Suport general a la recerca
Investigadors postdoctorals
Estudiants de doctorat
Estudiants de grau o màster
Descripció general
Al grup de genètica i genòmica de rosàcies ens interessen diferents aspectes de l'organització, la variabilitat i l'evolució del genoma que ajuden a dilucidar la genètica de caràcters agronòmics importants. Les espècies estudiades inclouen la poma, el préssec i la maduixa com a cultius principals i l'ametlla, l'albercoc, la pruna japonesa, la cirera, la pera, el gerd i la mora com a cultius secundaris relacionats. El nostre objectiu és aplicar aquesta informació per desenvolupar eines, com marcadors moleculars d'alta qualitat per a la selecció assistida per marcadors (MAS) i materials genètics (incloses col·leccions de línies d'introgressió), per augmentar l'eficiència de la millora vegetal. Fem aquestes activitats en estreta col·laboració amb empreses del sector.
En els estudis de fruiters realitzem mapes de lligament i estudis d'associació de tot el genoma utilitzant la variabilitat genètica existent en espècies silvestres i cultivades i marcadors d'alta densitat derivats de tecnologies de seqüenciació de nova generació (NGS). També realitzem anàlisis comparatives del genoma entre diferents espècies de rosàcies. Ens interessa entendre la genètica de la qualitat de la fruita, la resistència a l'estrès biòtic i abiòtic i altres caràcters agronòmics, i desenvolupar estratègies per a la introgressió ràpida i eficient de gens de interès en cultivars d'alta qualitat.
En els estudis de fruits vermells, ens interessa especialment entendre la genètica dels caràcters de qualitat de la fruita. A la maduixa ens centrem en la comparació dels genomes de maduixes diploides (silvestres) i octoploides (cultivades), per caracteritzar els QTL associats amb el sabor de la fruita, incloent sucre, aromes i contingut de polifenols. També estem explorant l'ús d'estratègies de selecció genòmica per millorar la maduixa cultivada.
Publicacions seleccionades
Dujak C.; Coleto-Alcudia V.; Aranzana M.J.
Genomic analysis of fruit size and shape traits in apple: unveiling candidate genes through GWAS analysis
(2024) Horticulture Research, vol. 11 (2), Art. number uhad270 (DOI:10.1093/hr/uhad270)
Jurado-Rui F.; Rousseau D.; Botía J.A.; Aranzana M.J.
PERSEUS: an interactive and intuitive web-based tool for pedigree visualization
(2024) Bioinformatics, vol. 40 (2), Art. number btae060 (DOI:10.1093/bioinformatics/btae060)
Jurado-Rui F.; Rousseau D.; Botía J.A.; Aranzana M.J.
GenoDrawing: An Autoencoder Framework for Image Prediction from SNP Markers
(2023) Plant Phenomics, vol. 5 Art. number 0113 (DOI:10.34133/plantphenomics.0113)
Fiol A.; García-Gómez B.E.; Jurado-Ruiz F.; Alexiou K.; Howad W.; Aranzana M.J.
Characterization of Japanese Plum (Prunus salicina) PsMYB10 Alleles Reveals Structural Variation and Polymorphisms Correlating With Fruit Skin Color
(2022) Horticulture Research, vol. 9 Art. number uhac206 (DOI:10.1093/hr/uhac206)
Fiol A.; García-Gómez B.E.; Jurado-Ruiz F.; Alexiou K.; Howad W.; Aranzana M.J.
Characterization of Japanese Plum (Prunus salicina) PsMYB10 Alleles Reveals Structural Variation and Polymorphisms Correlating With Fruit Skin Color
(2021) Frontiers in Plant Science, vol. 12 Art. number 655267 (DOI:10.3389/fpls.2021.655267)
Aranzana M.J.; Decroocq V.; Dirlewanger E.; Eduardo I.; Gao Z.S.; Gasic K.; Iezzoni A.; Jung S.; Peace C.; Prieto H.; Tao R.; Verde I.; Abbott A.G.; Arús P.
Prunus genetics and applications after de novo genome sequencing: achievements and prospects
(2019) Horticulture Research, vol. 6 (1), Art. number 58 (DOI:10.1038/s41438-019-0140-8)
de los Cobos F.P.; García-Gómez B.E.; Orduña-Rubio L.; Batlle I.; Arús P.; Matus J.T.; Eduardo I.
Article Exploring large-scale gene coexpression networks in peach (Prunus persica L.): a new tool for predicting gene function
(2024) Horticulture Research, vol. 11 (2), Art. number uhad294 (DOI:10.1093/hr/uhad294)
de los Cobos F.P.; Coindre E.; Dlalah N.; Quilot-Turion B.; Batlle I.; Arús P.; Eduardo I.; Duval H.
Construction of a collection of introgression lines of "Texas" almond DNA fragments in the "Earlygold" peach genetic background
(2023) Horticulture Research, vol. 10 (10), Art. number uhad193 (DOI:10.1093/hr/uhad193)
Zaracho N.; Reig G.; Kalluri N.; Arús P.; Eduardo I.
Construction of a collection of introgression lines of "Texas" almond DNA fragments in the "Earlygold" peach genetic background
(2023) Plants, vol. 12 (2), Art. number 394 (DOI:10.3390/plants12020394)
Kalluri N.; Serra O.; Donoso J.M.; Picañol R.; Howad W.; Eduardo I.; Arús P.
Construction of a collection of introgression lines of "Texas" almond DNA fragments in the "Earlygold" peach genetic background
(2022) Horticulture Research, vol. 9 Art. number uhac070 (DOI:10.1093/hr/uhac070)
Pérez de los Cobos F.; Martínez-García P.J.; Romero A.; Miarnau X.; Eduardo I.; Howad W.; Mnejja M.; Dicenta F.; Socias i Company R.; Rubio-Cabetas M.J.; Gradziel T.M.; Wirthensohn M.; Duval H.; Holland D.; Arús P.; Vargas F.J.; Batlle I.
Pedigree analysis of 220 almond genotypes reveals two world mainstream breeding lines based on only three different cultivars
(2021) Horticulture Research, vol. 8 (1), Art. number 11 (DOI:10.1038/s41438-020-00444-4)
Eduardo I.; Alegre S.; Alexiou K.G.; Arús P.
Resynthesis: Marker-Based Partial Reconstruction of Elite Genotypes in Clonally-Reproducing Plant Species
(2020) Frontiers in Plant Science, vol. 11 Art. number 1205 (DOI:10.3389/fpls.2020.01205)
Alioto T.; Alexiou K.G.; Bardil A.; Barteri F.; Castanera R.; Cruz F.; Dhingra A.; Duval H.; Fernández i Martí Á.; Frias L.; Galán B.; García J.L.; Howad W.; Gómez-Garrido J.; Gut M.; Julca I.; Morata J.; Puigdomènech P.; Ribeca P.; Rubio Cabetas M.J.; Vlasova A.; Wirthensohn M.; Garcia-Mas J.; Gabaldón T.; Casacuberta J.M.; Arús P.
Transposons played a major role in the diversification between the closely related almond and peach genomes: results from the almond genome sequence
(2020) Plant Journal, vol. 101 (2), pp. 455 -472 (DOI:10.1111/tpj.14538)
Rey-Serra P.; Mnejja M.; Monfort A.
Inheritance of esters and other volatile compounds responsible for the fruity aroma in strawberry
(2022) Frontiers in Plant Science, vol. 13 Art. number 959155 (DOI:10.3389/fpls.2022.959155)
Zingaretti L.M.; Monfort A.; Pérez-Enciso M.
Automatic fruit morphology phenome and genetic analysis: An application in the octoploid strawberry
(2021) Plant Phenomics, vol. 2021 Art. number 981291 (DOI:10.34133/2021/9812910)
Rey-Serra P.; Mnejja M.; Monfort A.
Shape, firmness and fruit quality QTLs shared in two non-related strawberry populations
(2021) Plant Science, vol. 311 Art. number 111010 (DOI:10.1016/j.plantsci.2021.111010)