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Redes reguladoras de genes en el desarrollo vegetal
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Descripción general
Los procesos de desarrollo en los organismos pluricelulares dependen de la capacidad celular de expresión génica diferencial. El objetivo global de nuestro grupo es la caracterización y comprensión de las redes de regulación génica que subyacen al desarrollo vegetal, utilizando una combinación de métodos genómicos, proteómicos y genéticos.
Utilizamos el desarrollo floral de Arabidopsis como modelo y sistema experimental primario, ya que el inicio de la formación floral y el proceso de desarrollo floral son excelentes paradigmas para los estudios de desarrollo en plantas. Mediante el análisis de datos transcriptómicos y de unión de factores de transcripción en todo el genoma, hemos caracterizado el papel del gen de identidad del meristemo floral y del órgano APETALA1 como eje de la red e interruptor del desarrollo que orquesta el inicio del desarrollo floral. Estamos utilizando enfoques similares para caracterizar otros reguladores transcripcionales implicados en el desarrollo floral;
Estos y otros estudios están proporcionando una visión global y dinámica del proceso de desarrollo floral. Sin embargo, esta visión se basa principalmente en la medición de la expresión génica a nivel del transcriptoma. Por ello, un área de actividad actual adicional del grupo es combinar tecnologías genómicas, proteómicas y peptidómicas para estudiar estos procesos, y determinar cómo se correlacionan el transcriptoma y el proteoma a lo largo del desarrollo floral en Arabidopsis.
Estos análisis de todo el genoma también identifican un gran número de genes diana de factores de transcripción, la mayoría de los cuales no están caracterizados, pero que ahora pueden estudiarse utilizando el amplio conjunto de herramientas genéticas y moleculares de Arabidopsis.
Publicaciones Seleccionadas
Álvarez-Urdiola, R., Borràs, E., Valverde, F., Matus, J. T., Sabidó, E., and Riechmann, J.L.
Peptidomics methods applied to the study of flower development
(2023) Methods in Molecular Biology, vol. 2686, pp. 509-536.
Álvarez-Urdiola, R., Matus, J. T., and Riechmann, J.L.
Multi-omics methods applied to flower development
(2023) Methods in Molecular Biology, vol. 2686, pp. 495-508.
Fàbregas, N., Lozano-Elena, F., Blasco-Escámez, D., Tohge, T., Martínez-Andújar, C., Albacete, A., Osorio, S., Bustamante, M., Riechmann, J.L., Nomura, T., Yokota, T., Conesa, A., Alfocea, F.P., Fernie, A.R., Caño-Delgado, A.I.
Overexpression of the vascular brassinosteroid receptor BRL3 confers drought resistance without penalizing plant growth
(2018) Nature Communications, vol. 9 (1), Art. number 4680
Bustamante, M., Matus, J.T., Riechmann, J.L.
Genome-wide analyses for dissecting gene regulatory networks in the shoot apical meristem
(2016) Journal of Experimental Botany, vol. 67 (6), pp. 1639-1648
Pajoro, A., Madrigal, P., Muiño, J.M., Matus, J.T., Jin, J., Mecchia, M.A., Debernardi, J.M., Palatnik, J.F., Balazadeh, S., Arif, M., Ó'Maoiléidigh, D.S., Wellmer, F., Krajewski, P., Riechmann, J.-L., Angenent, G.C., Kaufmann, K.
Dynamics of chromatin accessibility and gene regulation by MADS-domain transcription factors in flower development
(2014) Genome Biology, vol. 15 (3), Art. number R41
Wellmer, F., Bowman, J.L., Davies, B., Ferrándiz, C., Fletcher, J.C., Franks, R.G., Graciet, E., Gregis, V., Ito, T., Jack, T.P., Jiao, Y., Kater, M.M., Ma, H., Meyerowitz, E.M., Prunet, N., Riechmann, J.L.
Flower development: Open questions and future directions
(2014) Methods in Molecular Biology, vol. 1110, pp. 103-124
Wellmer, F., Graciet, E., Riechmann, J.L.
Specification of floral organs in Arabidopsis
(2014) Journal of Experimental Botany, vol. 65 (1), pp. 1-9
Huang, W., Pérez-García, P., Pokhilko, A., Millar, A.J., Antoshechkin, I., Riechmann, J.L., Mas, P.
Mapping the core of the Arabidopsis circadian clock defines the network structure of the oscillator
(2012) Science, vol. 335 (6077), pp. 75-79
Ferrier, T., Matus, J.T., Jin, J., Riechmann, J.L.
Arabidopsis paves the way: Genomic and network analyses in crops
(2011) Current Opinion in Biotechnology, vol. 22 (2), pp. 260-270
Wellmer, F., Riechmann, J.L.
Gene networks controlling the initiation of flower development
(2010) Trends in Genetics, vol. 26 (12), pp. 519-527
Kaufmann, K., Wellmer, F., Muiñ, J.M., Ferner, T., Wuest, S.E., Kumar, V., Serrano-Mislata, A., Madueño, F., Kraiewski, P., Meyerowitz, E.M., Angenent, G.C., Riechmann, J.L.
Orchestration of floral initiation by APETALA1
(2010) Science, vol. 328 (5974), pp. 85-89