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Genómica de Plantas y Animales

El objetivo del Programa de Genómica Vegetal y Animal es el estudio de la organización, la variabilidad y la evolución de los genomas de las plantas cultivadas y los animales domésticos, para dilucidar la genética de los caracteres relevantes para especies de interés agrícola.

Para ello utilizamos una variedad de  aproximaciones genéticas, genómicas o de bioinformática que aplicamos a una amplia gama de especies de plantas y animales, incluyendo las cucurbitáceas y diferentes especies rosáceas, así como cerdos y cabras. El Programa también trabaja en el desarrollo de nuevos métodos de bioinformática y herramientas de software para analizar los datos generados por las aproximaciones de NGS.

Los objetivos finales del programa son mejorar nuestro conocimiento de la estructura y evolución de los genomas complejos, así como el desarrollo de aproximaciones metodológicas que se puedan aplicar a los programas comerciales de mejora a través de contratos con empresas o acuerdos con las organizaciones públicas.

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Publicaciones

Cirera S., Clop A., Jacobsen M.J., Guerin M., Lesnik P., Jørgensen C.B., Fredholm M., Karlskov-Mortensen P.
(2018) Animal Genetics, vol. 49 (2), pp. 110-118
Gòdia M., Mayer F.Q., Nafissi J., Castelló A., Rodríguez-Gil J.E., Sánchez A., Clop A.
(2018) Systems Biology in Reproductive Medicine, vol. 64 (4), pp. 291-303
Stella A., Nicolazzi E.L., Van Tassell C.P., Rothschild M.F., Colli L., Rosen B.D., Sonstegard T.S., Crepaldi P., Tosser-Klopp G., Joost S., Amills M., Ajmone-Marsan P., Bertolini F., Boettcher P., Boyle Onzima R., Bradley D., Buja D., Cano Pereira M.E., Carta A., Catillo G., Crisà A., Del Corvo M., Daly K., Droegemueller C., Duruz S., Elbeltagi A., Esmailizadeh A., Faco O., Figueiredo Cardoso T., Flury C., Garcia J.F., Guldbrandtsen B., Haile A., Hallsteinn Hallsson J., Heaton M., Hunnicke Nielsen V., Huson H., Kijas J., Lenstra J.A., Marras G., Milanesi M., Minhui C., Moaeen-Ud-Din M., Morry O'Donnell R., Moses Danlami O., Mwacharo J., Palhière I., Pilla F., Poli M., Reecy J., Rischkowsky B.A., Rochat E., Rupp R., Sayre B., Servin B., Silva K., Spangler G., Steri R., Talenti A., Tortereau F., Vajana E., Zhang W.
(2018) Genetics Selection Evolution, vol. 50 (1), Art. número 61
Núñez-Hernández F., Vera G., Sánchez A., Rodríguez F., Núñez J.I.
(2018) BMC Veterinary Research, vol. 14 (1), Art. número 268
Ruggieri V., Alexiou K.G., Morata J., Argyris J., Pujol M., Yano R., Nonaka S., Ezura H., Latrasse D., Boualem A., Benhamed M., Bendahmane A., Cigliano R.A., Sanseverino W., Puigdomènech P., Casacuberta J.M., Garcia-Mas J.
(2018) Scientific Reports, vol. 8 (1), Art. número 8088
Laurens F., Aranzana M.J., Arus P., Bassi D., Bink M., Bonany J., Caprera A., Corelli-Grappadelli L., Costes E., Durel C.-E., Mauroux J.-B., Muranty H., Nazzicari N., Pascal T., Patocchi A., Peil A., Quilot-Turion B., Rossini L., Stella A., Troggio M., Velasco R., Van De Weg E.
(2018) Horticulture Research, vol. 5 (1), Art. número 11
Cardoso T.F., Quintanilla R., Castelló A., Mármol-Sánchez E., Ballester M., Jordana J., Amills M.
(2018) Frontiers in Genetics, vol. 9 (OCT), Art. número 475
Dettori M.L., Pazzola M., Paschino P., Amills M., Vacca G.M.
(2018) Journal of Dairy Science, vol. 101 (11), pp. 9978-9986
Foster T.M., Aranzana M.J.
(2018) Horticulture Research, vol. 5 (1), Art. número 44
Bellot P., de Los Campos G., Pérez-Enciso M.
(2018) Genetics, vol. 210 (3), pp. 809-819
Crespo-Piazuelo D., Estellé J., Revilla M., Criado-Mesas L., Ramayo-Caldas Y., Óvilo C., Fernández A.I., Ballester M., Folch J.M.
(2018) Scientific Reports, vol. 8 (1), Art. número 12727
Ginja C., Cortés O., Gama L.T., Delgado J.V., Amills M., De Sousa C.B., Cañón J., Capote J., Dunner S., Ferrando A., Carpio M.G., Gómez M., Jordana J., Landi V., Manunza A., Martin-Burriel I., Barro A.P., Rodellar C., Santos-Silva F., Sevane N., Vidal O., Zaragoza P., Martínez A.M.
(2018) Sustainable Goat Production in Adverse Environments, vol. 1, pp. 509-533
Cardoso T.F., Quintanilla R., Castelló A., González-Prendes R., Amills M., Cánovas
(2018) BMC Genomics, vol. 19 (1), Art. número 145
Sevane N., Cortés O., Gama L.T., Martínez A., Zaragoza P., Amills M., Bedotti D.O., Bruno de Sousa C., Cañon J., Dunner S., Ginja C., Lanari M.R., Landi V., Sponenberg P., Delgado J.V., The Biogoat Consortium A
(2018) Animal (Article in Press), pp. 1-10
Casacuberta J.M., Puigdomènech P.
(2018) Nature, vol. 561 (7721), pp. 33
Revilla M., Puig-Oliveras A., Crespo-Piazuelo D., Criado-Mesas L., Castelló A., Fernández A.I., Ballester M., Folch J.M.
(2018) Scientific Reports, vol. 8 (1), Art. número 2045
Noce A., Cardoso T.F., Manunza A., Martínez A., Cánovas A., Pons A., Bermejo L.A., Landi V., Sànchez A., Jordana J., Delgado J.V., Adán S., Capote J., Vidal O., Pazzola M., Vacca G.M., Casellas J., Amills M.
(2018) Scientific Reports, vol. 8 (1), Art. número 10486
Rodriguez-Valera Y., Renand G., Naves M., Fonseca-Jiménez Y., Moreno-Probance T.I., Ramos-Onsins S., Rocha D., Ramayo-Caldas Y.
(2018) Scientific Reports, vol. 8 (1), Art. número 11005
Lü P., Yu S., Zhu N., Chen Y.-R., Zhou B., Pan Y., Tzeng D., Fabi J.P., Argyris J., Garcia-Mas J., Ye N., Zhang J., Grierson D., Xiang J., Fei Z., Giovannoni J., Zhong S.
(2018) Nature Plants, vol. 4 (10), pp. 784-791
Bertolini F., Cardoso T.F., Marras G., Nicolazzi E.L., Rothschild M.F., Amills M.
(2018) Genetics Selection Evolution, vol. 50 (1), Art. número 59
Goonetilleke S.N., March T.J., Wirthensohn M.G., Arús P., Walker A.R., Mather D.E.
(2018) G3: Genes, Genomes, Genetics, vol. 8 (1), pp. 161-172
da Silva Linge C., Antanaviciute L., Abdelghafar A., Arús P., Bassi D., Rossini L., Ficklin S., Gasic K.
(2018) PloS one, vol. 13 (11), pp. e0207724
Iacolina L., Pertoldi C., Amills M., Kusza S., Megens H.-J., Bâlteanu V.A., Bakan J., Cubric-Curic V., Oja R., Saarma U., Scandura M., Šprem N., Stronen A.V.
(2018) Scientific Reports, vol. 8 (1), Art. número 17372
Cantín C.M., Arús P., Eduardo I.
(2018) BMC Research Notes, vol. 11 (1), Art. número 386
Cardoso T.F., Amills M., Bertolini F., Rothschild M., Marras G., Boink G., Jordana J., Capote J., Carolan S., Hallsson J.H., Kantanen J., Pons A., Lenstra J.A.
(2018) Genetics Selection Evolution, vol. 50 (1), Art. número 56
Morata J., Marín F., Payet J., Casacuberta J.M.
(2018) Genome Biology and Evolution, vol. 10 (5), pp. 1210-1220
Guirao-Rico S., Ramirez O., Ojeda A., Amills M., Ramos-Onsins S.E.
(2018) Heredity, vol. 120 (1), pp. 63-76
Casacuberta J.M., Puigdomènech P.
(2018) EMBO Reports, vol. 19 (10), Art. número e46907
Hudson N.J., Naval-Sánchez M., Porto-Neto L., Pérez-Enciso M., Reverter A.
(2018) Journal of Animal Science, vol. 96 (8), pp. 3064-3069
Ballester M., Amills M., González-Rodríguez O., Cardoso T.F., Pascual M., González-Prendes R., Panella-Riera N., Díaz I., Tibau J., Quintanilla R.
(2018) BMC Genomics, vol. 19 (1), Art. número 682

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