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Genómica de Plantas y Animales

El objetivo del Programa de Genómica Vegetal y Animal es el estudio de la organización, la variabilidad y la evolución de los genomas de las plantas cultivadas y los animales domésticos, para dilucidar la genética de los caracteres relevantes para especies de interés agrícola.

Para ello utilizamos una variedad de  aproximaciones genéticas, genómicas o de bioinformática que aplicamos a una amplia gama de especies de plantas y animales, incluyendo las cucurbitáceas y diferentes especies rosáceas, así como cerdos y cabras. El Programa también trabaja en el desarrollo de nuevos métodos de bioinformática y herramientas de software para analizar los datos generados por las aproximaciones de NGS.

Los objetivos finales del programa son mejorar nuestro conocimiento de la estructura y evolución de los genomas complejos, así como el desarrollo de aproximaciones metodológicas que se puedan aplicar a los programas comerciales de mejora a través de contratos con empresas o acuerdos con las organizaciones públicas.

Páginas

Publicaciones

Cirera S., Clop A., Jacobsen M.J., Guerin M., Lesnik P., Jørgensen C.B., Fredholm M., Karlskov-Mortensen P.
(2018) Animal Genetics, vol. 49 (2), pp. 110-118
Gòdia M., Mayer F.Q., Nafissi J., Castelló A., Rodríguez-Gil J.E., Sánchez A., Clop A.
(2018) Systems Biology in Reproductive Medicine, vol. 64 (4), pp. 291-303
Ruggieri V., Alexiou K.G., Morata J., Argyris J., Pujol M., Yano R., Nonaka S., Ezura H., Latrasse D., Boualem A., Benhamed M., Bendahmane A., Cigliano R.A., Sanseverino W., Puigdomènech P., Casacuberta J.M., Garcia-Mas J.
(2018) Scientific Reports, vol. 8 (1), Art. número 8088
Laurens F., Aranzana M.J., Arus P., Bassi D., Bink M., Bonany J., Caprera A., Corelli-Grappadelli L., Costes E., Durel C.-E., Mauroux J.-B., Muranty H., Nazzicari N., Pascal T., Patocchi A., Peil A., Quilot-Turion B., Rossini L., Stella A., Troggio M., Velasco R., Van De Weg E.
(2018) Horticulture Research, vol. 5 (1), Art. número 11
Ginja C., Cortés O., Gama L.T., Delgado J.V., Amills M., De Sousa C.B., Cañón J., Capote J., Dunner S., Ferrando A., Carpio M.G., Gómez M., Jordana J., Landi V., Manunza A., Martin-Burriel I., Barro A.P., Rodellar C., Santos-Silva F., Sevane N., Vidal O., Zaragoza P., Martínez A.M.
(2018) Sustainable Goat Production in Adverse Environments, vol. 1, pp. 509-533
Cardoso T.F., Quintanilla R., Castelló A., González-Prendes R., Amills M., Cánovas
(2018) BMC Genomics, vol. 19 (1), Art. número 145
Sevane N., Cortés O., Gama L.T., Martínez A., Zaragoza P., Amills M., Bedotti D.O., Bruno de Sousa C., Cañon J., Dunner S., Ginja C., Lanari M.R., Landi V., Sponenberg P., Delgado J.V., The Biogoat Consortium A
(2018) Animal (Article in Press), pp. 1-10
Revilla M., Puig-Oliveras A., Crespo-Piazuelo D., Criado-Mesas L., Castelló A., Fernández A.I., Ballester M., Folch J.M.
(2018) Scientific Reports, vol. 8 (1), Art. número 2045
Goonetilleke S.N., March T.J., Wirthensohn M.G., Arús P., Walker A.R., Mather D.E.
(2018) G3: Genes, Genomes, Genetics, vol. 8 (1), pp. 161-172
Cantín C.M., Arús P., Eduardo I.
(2018) BMC Research Notes, vol. 11 (1), Art. número 386
Guirao-Rico S., Ramirez O., Ojeda A., Amills M., Ramos-Onsins S.E.
(2018) Heredity, vol. 120 (1), pp. 63-76
Naval-Sanchez M., Nguyen Q., McWilliam S., Porto-Neto L.R., Tellam R., Vuocolo T., Reverter A., Perez-Enciso M., Brauning R., Clarke S., McCulloch A., Zamani W., Naderi S., Rezaei H.R., Pompanon F., Taberlet P., Worley K.C., Gibbs R.A., Muzny D.M., Jhangiani S.N., Cockett N., Daetwyler H., Kijas J.
(2018) Nature Communications, vol. 9 (1), Art. número 859
Sastre N., Calvete O., Martínez-Vargas J., Medarde N., Casellas J., Altet L., Sánchez A., Francino O., Ventura J.
(2018) Parasitology Research, vol. 117 (7), pp. 2139-2148
Ninot A., Howad W., Aranzana M.J., Senar R., Romero A., Mariotti R., Baldoni L., Belaj A.
(2018) Scientia Horticulturae, vol. 231, pp. 253-264
Kirikci K., Noce A., Cam M.A., Mercan L., Amills M.
(2018) Small Ruminant Research, vol. 162, pp. 25-29
Ferretti L., Klassmann A., Raineri E., Ramos-Onsins S.E., Wiehe T., Achaz G.
(2018) Theoretical Population Biology (Article in Press)
Lang D., Ullrich K.K., Murat F., Fuchs J., Jenkins J., Haas F.B., Piednoel M., Gundlach H., Van Bel M., Meyberg R., Vives C., Morata J., Symeonidi A., Hiss M., Muchero W., Kamisugi Y., Saleh O., Blanc G., Decker E.L., van Gessel N., Grimwood J., Hayes R.D., Graham S.W., Gunter L.E., McDaniel S.F., Hoernstein S.N.W., Larsson A., Li F.-W., Perroud P.-F., Phillips J., Ranjan P., Rokshar D.S., Rothfels C.J., Schneider L., Shu S., Stevenson D.W., Thümmler F., Tillich M., Villarreal Aguilar J.C., Widiez T., Wong G.K.-S., Wymore A., Zhang Y., Zimmer A.D., Quatrano R.S., Mayer K.F.X., Goodstein D., Casacuberta J.M., Vandepoele K., Reski R., Cuming A.C., Tuskan G.A., Maumus F., Salse J., Schmutz J., Rensing S.A.
(2018) Plant Journal, vol. 93 (3), pp. 515-533
Corujo M., Pla M., van Dijk J., Voorhuijzen M., Staats M., Slot M., Lommen A., Barros E., Nadal A., Puigdomènech P., Paz J.L.L., van der Voet H., Kok E.
(2018) Food Chemistry (Article in Press)
Martínez-Montes Á.M., Fernández A., Muñoz M., Noguera J.L., Folch J.M., Fernández A.I.
(2018) PLoS ONE, vol. 13 (3), Art. número e0190184
López-Girona E., Zhang Y., Eduardo I., Mora J.R.H., Alexiou K.G., Arús P., Aranzana M.J.
(2017) Scientific Reports, vol. 7 (1), Art. número 6714
Eusebi P.G., González-Prendes R., Quintanilla R., Tibau J., Cardoso T.F., Clop A., Amills M.
(2017) Animal Genetics, vol. 48 (4), pp. 466-469
Amills M., Megens H.-J., Manunza A., Ramos-Onsins S.E., Groenen M.A.M.
(2017) Ecology, Conservation and Management of Wild Pigs and Peccaries, pp. 376-387
Giner A., Pascual L., Bourgeois M., Gyetvai G., Rios P., Picó B., Troadec C., Bendahmane A., Garcia-Mas J., Martín-Hernández A.M.
(2017) Scientific Reports, vol. 7 (1), Art. número 10471
Leno-Colorado J., Hudson N.J., Reverter A., Pérez-Enciso M.
(2017) G3: Genes, Genomes, Genetics, vol. 7 (7), pp. 2171-2184
Tenreira T., Pimenta Lange M.J., Lange T., Bres C., Labadie M., Monfort A., Hernould M., Rothan C., Denoyes B.
(2017) Plant Cell, vol. 29 (9), pp. 2168-2182
Pérez-Enciso M.
(2017) Journal of Animal Breeding and Genetics, vol. 134 (2), pp. 85-86
Ballester M., Puig-Oliveras A., Castelló A., Revilla M., Fernández A.I., Folch J.M.
(2017) Animal Genetics, vol. 48 (6), pp. 660-668
Rodriguez-Cortes A., Martori C., Martinez-Florez A., Clop A., Amills M., Kubejko J., Llull J., Nadal J.M., Alberola J.
(2017) Scientific Reports, vol. 7 (1), Art. número 3346
Cuscó A., Sánchez A., Altet L., Ferrer L., Francino O.
(2017) Frontiers in Veterinary Science, vol. 4 (JUL), Art. número 119
Martínez-Montes A.M., Muiños-Bühl A., Fernández A., Folch J.M., Ibáñez-Escriche N., Fernández A.I.
(2017) Mammalian Genome, vol. 28 (3-4), pp. 130-142

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