Overview

La investigación del Programa de Genómica Vegetal y Animal se centra principalmente en comprender la organización, evolución y variabilidad de los genomas de cultivos y animales domésticos, desvelar su proceso de domesticación y dilucidar la base genética de rasgos importantes para la mejora de cultivos y ganado.

El Programa está estructurado en seis grupos de investigación, que utilizan de forma rutinaria una amplia gama de enfoques genéticos, genómicos, paleogenómicos, bioinformáticos, estadísticos, de genética de poblaciones y fenotípicos en cultivos como el melón, el melocotón, la manzana, la fresa y el trigo, y especies ganaderas como el cerdo y la cabra, entre otros. Desarrollamos metodologías bioinformáticas y herramientas de software para el análisis de datos genómicos. También aplicamos tecnologías de edición genética para la validación funcional de genes candidatos para rasgos de interés;

El principal objetivo del Programa de Genómica Vegetal y Animal es traducir la información genómica en fenotipos, por lo que algunas de nuestras actividades de investigación se aplican a programas comerciales de mejora genética en colaboración con empresas privadas e instituciones públicas.

Publications

Batlle I.; Miarnau X.; Calle A.; Arus P.; Vargas F.J.

‘Intensia’, a New Dwarfing Almond × Peach Hybrid Rootstock for Almond and Peach (2024) HortScience, vol. 59 (9), pp. 1430 -1432 (DOI:10.21273/HORTSCI18021-24)

Ledford W.C.; Silvestri A.; Fiorilli V.; Roth R.; Rubio-Somoza I.; Lanfranco L.

A journey into the world of small RNAs in the arbuscular mycorrhizal symbiosis (2024) New Phytologist, vol. 242 (4), pp. 1534 -1544 (DOI:10.1111/nph.19394)

Liu B.; Shen C.-C.; Xia S.-W.; Song S.-S.; Su L.-H.; Li Y.; Hao Q.; Liu Y.-J.; Guan D.-L.; Wang N.; Wang W.-J.; Zhao X.; Li H.-X.; Li X.-X.; Lai Y.-S.

A nanopore-based cucumber genome assembly reveals structural variations at two QTLs controlling hypocotyl elongation (2024) Plant Physiology, vol. 195 (2), pp. 970 -985 (DOI:10.1093/plphys/kiae153)

Shi B.; Felipo-Benavent A.; Cerutti G.; Galvan-Ampudia C.; Jilli L.; Brunoud G.; Mutterer J.; Vallet E.; Sakvarelidze-Achard L.; Davière J.-M.; Navarro-Galiano A.; Walia A.; Lazary S.; Legrand J.; Weinstain R.; Jones A.M.; Prat S.; Achard P.; Vernoux T.

A quantitative gibberellin signaling biosensor reveals a role for gibberellins in internode specification at the shoot apical meristem (2024) Nature Communications, vol. 15 (1), Art. number 3895 (DOI:10.1038/s41467-024-48116-4)

Silvestri A.; Bansal C.; Rubio-Somoza I.

After silencing suppression: miRNA targets strike back (2024) Trends in Plant Science, (Article in press), (DOI:10.1016/j.tplants.2024.05.001)