Search
Genética y genómica de rosáceas
Personal
Personal
Investigadores
Servicios científicos
Apoyo general a la investigación
Investigadores postdoctorales
Estudiantes de doctorado
Estudiantes de pregrado o master
Descripción general
En el grupo de genética y genómica de rosáceas estamos interesados en diferentes aspectos de la organización, variabilidad y evolución del genoma, que ayudan a dilucidar la genética de caracteres agronómicos importantes. Las especies estudiadas incluyen manzano, melocotonero y fresa como cultivos principales y almendro, albaricoquero, ciruelo japonés, cerezo, peral, frambueso y zarzamora como cultivos secundarios relacionados. Nuestro objetivo es aplicar esta información para desarrollar herramientas, como marcadores moleculares para la selección asistida por marcadores (MAS) y materiales genéticos (incluidas colecciones de líneas de introgresión), con el fin de aumentar la eficacia de la mejora vegetal. Estas actividades las desarrollamos en estrecha colaboración con empresas del sector.
En los estudios de frutales realizamos mapas de ligamiento y estudios de asociación de todo el genoma utilizando la variabilidad genética existente en especies silvestres emparentadas y cultivadas y marcadores de alta densidad derivados de tecnologías de secuenciación de nueva generación (NGS). También realizamos análisis genómicos comparativos entre diferentes especies de rosáceas. Estamos interesados en comprender la genética de la calidad del fruto, la resistencia al estrés biótico y abiótico y otros caracteres agronómicos, y en desarrollar estrategias para la introgresión rápida y eficiente de genes de interés en cultivares de alta calidad.
En frutos rojos estamos especialmente interesados en comprender la genética de los caracteres de calidad de la fruta. En fresa nos centramos en la comparación de los genomas de especies diploides (silvestres) y octoploides (cultivadas), para caracterizar QTLs asociados al sabor de la fruta, incluyendo azúcar, aromas y contenido en polifenoles. También estamos explorando el uso de estrategias de selección genómica para mejorar la fresa cultivada.
Publicaciones Seleccionadas
Dujak C.; Coleto-Alcudia V.; Aranzana M.J.
Genomic analysis of fruit size and shape traits in apple: unveiling candidate genes through GWAS analysis
(2024) Horticulture Research, vol. 11 (2), Art. number uhad270 (DOI:10.1093/hr/uhad270)
Jurado-Rui F.; Rousseau D.; Botía J.A.; Aranzana M.J.
PERSEUS: an interactive and intuitive web-based tool for pedigree visualization
(2024) Bioinformatics, vol. 40 (2), Art. number btae060 (DOI:10.1093/bioinformatics/btae060)
Jurado-Rui F.; Rousseau D.; Botía J.A.; Aranzana M.J.
GenoDrawing: An Autoencoder Framework for Image Prediction from SNP Markers
(2023) Plant Phenomics, vol. 5 Art. number 0113 (DOI:10.34133/plantphenomics.0113)
Fiol A.; García-Gómez B.E.; Jurado-Ruiz F.; Alexiou K.; Howad W.; Aranzana M.J.
Characterization of Japanese Plum (Prunus salicina) PsMYB10 Alleles Reveals Structural Variation and Polymorphisms Correlating With Fruit Skin Color
(2022) Horticulture Research, vol. 9 Art. number uhac206 (DOI:10.1093/hr/uhac206)
Fiol A.; García-Gómez B.E.; Jurado-Ruiz F.; Alexiou K.; Howad W.; Aranzana M.J.
Characterization of Japanese Plum (Prunus salicina) PsMYB10 Alleles Reveals Structural Variation and Polymorphisms Correlating With Fruit Skin Color
(2021) Frontiers in Plant Science, vol. 12 Art. number 655267 (DOI:10.3389/fpls.2021.655267)
Aranzana M.J.; Decroocq V.; Dirlewanger E.; Eduardo I.; Gao Z.S.; Gasic K.; Iezzoni A.; Jung S.; Peace C.; Prieto H.; Tao R.; Verde I.; Abbott A.G.; Arús P.
Prunus genetics and applications after de novo genome sequencing: achievements and prospects
(2019) Horticulture Research, vol. 6 (1), Art. number 58 (DOI:10.1038/s41438-019-0140-8)
de los Cobos F.P.; García-Gómez B.E.; Orduña-Rubio L.; Batlle I.; Arús P.; Matus J.T.; Eduardo I.
Article Exploring large-scale gene coexpression networks in peach (Prunus persica L.): a new tool for predicting gene function
(2024) Horticulture Research, vol. 11 (2), Art. number uhad294 (DOI:10.1093/hr/uhad294)
de los Cobos F.P.; Coindre E.; Dlalah N.; Quilot-Turion B.; Batlle I.; Arús P.; Eduardo I.; Duval H.
Construction of a collection of introgression lines of "Texas" almond DNA fragments in the "Earlygold" peach genetic background
(2023) Horticulture Research, vol. 10 (10), Art. number uhad193 (DOI:10.1093/hr/uhad193)
Zaracho N.; Reig G.; Kalluri N.; Arús P.; Eduardo I.
Construction of a collection of introgression lines of "Texas" almond DNA fragments in the "Earlygold" peach genetic background
(2023) Plants, vol. 12 (2), Art. number 394 (DOI:10.3390/plants12020394)
Kalluri N.; Serra O.; Donoso J.M.; Picañol R.; Howad W.; Eduardo I.; Arús P.
Construction of a collection of introgression lines of "Texas" almond DNA fragments in the "Earlygold" peach genetic background
(2022) Horticulture Research, vol. 9 Art. number uhac070 (DOI:10.1093/hr/uhac070)
Pérez de los Cobos F.; Martínez-García P.J.; Romero A.; Miarnau X.; Eduardo I.; Howad W.; Mnejja M.; Dicenta F.; Socias i Company R.; Rubio-Cabetas M.J.; Gradziel T.M.; Wirthensohn M.; Duval H.; Holland D.; Arús P.; Vargas F.J.; Batlle I.
Pedigree analysis of 220 almond genotypes reveals two world mainstream breeding lines based on only three different cultivars
(2021) Horticulture Research, vol. 8 (1), Art. number 11 (DOI:10.1038/s41438-020-00444-4)
Eduardo I.; Alegre S.; Alexiou K.G.; Arús P.
Resynthesis: Marker-Based Partial Reconstruction of Elite Genotypes in Clonally-Reproducing Plant Species
(2020) Frontiers in Plant Science, vol. 11 Art. number 1205 (DOI:10.3389/fpls.2020.01205)
Alioto T.; Alexiou K.G.; Bardil A.; Barteri F.; Castanera R.; Cruz F.; Dhingra A.; Duval H.; Fernández i Martí Á.; Frias L.; Galán B.; García J.L.; Howad W.; Gómez-Garrido J.; Gut M.; Julca I.; Morata J.; Puigdomènech P.; Ribeca P.; Rubio Cabetas M.J.; Vlasova A.; Wirthensohn M.; Garcia-Mas J.; Gabaldón T.; Casacuberta J.M.; Arús P.
Transposons played a major role in the diversification between the closely related almond and peach genomes: results from the almond genome sequence
(2020) Plant Journal, vol. 101 (2), pp. 455 -472 (DOI:10.1111/tpj.14538)
Rey-Serra P.; Mnejja M.; Monfort A.
Inheritance of esters and other volatile compounds responsible for the fruity aroma in strawberry
(2022) Frontiers in Plant Science, vol. 13 Art. number 959155 (DOI:10.3389/fpls.2022.959155)
Zingaretti L.M.; Monfort A.; Pérez-Enciso M.
Automatic fruit morphology phenome and genetic analysis: An application in the octoploid strawberry
(2021) Plant Phenomics, vol. 2021 Art. number 981291 (DOI:10.34133/2021/9812910)
Rey-Serra P.; Mnejja M.; Monfort A.
Shape, firmness and fruit quality QTLs shared in two non-related strawberry populations
(2021) Plant Science, vol. 311 Art. number 111010 (DOI:10.1016/j.plantsci.2021.111010)