Search
Genómica estadística y poblacional
Personal
Descripción general
Nuestro objetivo es comprender los procesos evolutivos que tienen lugar en las poblaciones. Por un lado, desarrollamos métodos estadísticos y realizamos estudios de simulación con el objetivo de mejorar la detección de patrones específicos de variabilidad, utilizando la perspectiva de la genómica de poblaciones pero combinando también información sobre el fenotipo y el ambiente. Por otro lado, analizamos datos genómicos empíricos de poblaciones silvestres y domesticadas para detectar el efecto de la selección positiva y otros procesos evolutivos. En concreto, las líneas de investigación son las siguientes:
Desarrollo de Métodos y Software
Métodos para analizar la Variabilidad Genética: Desarrollamos metodologías estadísticas enfocadas a medir la variabilidad y en distinguir las diferentes fuerzas evolutivas, como detectar los efectos sobre caracteres afectados por selección positiva.
Desarrollar Software PopGen: desarrollar software para el análisis de la variabilidad es de gran importancia para difundir nuestras metodologías y permitir que otros investigadores realicen análisis utilizando nuestra perspectiva.
Estudio de datos empíricos
Variabilidad genética en poblaciones naturales: En estrecha colaboración con el Dr. M. Abdelaziz (Universidad de Granada) pretendemos explorar los efectos de los cambios en la ploidía y en los sistemas de apareamiento sobre los mecanismos ecológicos y genéticos que a su vez median en los patrones selectivos (trayectorias adaptativas) que aparecen en diferentes ambientes.
Variabilidad genética en poblaciones domesticadas: En las especies domésticas se espera que la selección artificial actúe sobre fenotipos de interés para los humanos. Nos interesa la arquitectura genética de la adaptación por domesticación. ¿Actúa la selección sobre rasgos cuantitativos en todo el genoma o solo en regiones específicas? Los estudios de simulación pueden ayudar a definir las expectativas bajo cada hipótesis y a establecer el poder estadístico para distinguir ambas hipótesis.
Más información en https://sites.google.com/view/sebas-ramos-onsins-lab
Publicaciones Seleccionadas
Ramos-Onsins SE, Marmorini G, Achaz G, Ferretti L.
A General Framework for Neutrality Tests Based on the Site Frequency Spectrum (2023)
(2023) Genes. 14(9):1714. doi: 10.3390/genes14091714.
Ferretti L, Ribeca P, Ramos-Onsins SE.
The Site Frequency/Dosage Spectrum of Autopolyploid Populations.
(2018) Front Genet. 9:480. doi: 10.3389/fgene.2018.00480. eCollection
Guirao-Rico, S., Ramirez, O., Ojeda, A., Amills, M., Ramos-Onsins, S.E.
Porcine Y-chromosome variation is consistent with the occurrence of paternal gene flow from non-Asian to Asian populations
(2018) Heredity, vol. 120 (1), pp. 63-76
Rozas, J., Ferrer-Mata, A., Sanchez-DelBarrio, J.C., Guirao-Rico, S., Librado, P., Ramos-Onsins, S.E., Sanchez-Gracia, A.
DnaSP 6: DNA sequence polymorphism analysis of large data sets
(2017) Molecular Biology and Evolution, vol. 34 (12), pp. 3299-3302